御坊堂的渊源由来已久，清朝咸丰年间，有一位姓黄的宫廷御医穷其精力炼制成一种以海狗肾为主要原料补肾健体，延年益寿的丹丸，取名“海狗丸”。良好的效果深受宫廷显贵珍爱，其配方也就成为黄氏家族的历代不传秘方。后来，黄御医告老还乡，在南方老家开了一家药号“草坊堂”，皇上知道后，念及黄老先生对宫廷所作的贡献，故赐堂号为“御坊堂”。当时也在民间流传着这样一句话：北有同仁堂，南有御坊堂。